捷運聯合開發建物採共構型態設置時，預防各類災害造成人命、財物損失成為安全最重要的考量，此基於多功能複合式建築物可能涵蓋住宅、百貨、飯店和交通轉運站等結構物型態，其逃生及救援均較困難均較一般大樓複雜，以致捷運公司會透過災害防治作業辦法訂定 ( SOP For Risk Prevent in Station ) 及聯合演訓，達到降低災害發生機率，更會將災害防治機制延伸到聯合開發建物的使用單位。

通盤性之防災考量
近期行政院災防會訂定「 內政部火災爆炸應變計畫 」，將交通設施、BOT 聯合開發、多功能複合式建築物等防災設計納入規範執行，諸如：三鐵共構、京九、統一阪急...等複合式建築物必須考慮其未來營運的防災連動需求。但基於複合式空間規劃具有十分複雜的防災規劃特性，以致計畫開始就必須進行通盤規劃和設計，除了依循現行法規進行監造建築物和安裝防災設備，更需考量人潮如何疏散、各空間防災應變連動等問題，在災害發生時才能將傷亡減至最低程度。

分段實施的查驗設計
台灣超過 95% 的消防設備商仰賴電機技師來爭取市場銷售服務機會，電機技師通常只在意以較低成本完成專案規劃和服務回饋，但其關注重點和業主卻可能不盡相同，安全危機極可能潛藏在複合式建築物之規劃、施工和使用過程中。 以施工問題為例，由於牽涉用途變更，消防局和建管處勢必得改變傳統審核規範，也可能因為台灣工程沒有落實專業者監造，都將影響後續工程技術安全和消防檢查的時程，這也造成業主信心不足的關鍵因素。以某捷運共構建案為例，業主端反應承攬商、設計規劃者皆無法解決施工用途變更問題，一旦消防檢查發現缺失將為時以晚。

完整的聯合防護策略
複合式建築物的不同用途空間都必須具備各自防災搶救計畫之風險概念，且進行定量化的災害情境模擬，進而擴大整合其他不同用途空間的防災規劃，即所謂複合式建築物的聯合防護策略，方能真正確保複合式建築物的防火防災安全。
不同空間的緩衝區設置防火鐵捲門，如何讓其啟動運作，且正確指引逃生避難方向，依賴有效的連動系統，但由於捷運、賣場、飯店等不同系統往往難以整合，正是當前系統連動的問題所在。再者，一旦百貨公司或地下場站發生火警事故，面對龐大的人群該如何疏散將極為重要，以致於人流計算將關係到連通 / 共通通道、安全梯等逃生設施之建置數量。最後，為了防範錯誤發生，除了營造廠商必須正確採購外，排煙風管和閘門等驗證測試是有其必要性，只不過台灣尚缺乏類似測試實驗室和國家驗證標準，值得政府相關單位關注的重大課題。